在大军逼近桂林的情况下，桂林已经不战自乱，人心涣散，不少官员纷纷挂印而去，就连靖江王亲封的东阁大学士孙金鼎，也逃出桂林。

他同陈邦傅是儿女亲家，于是跑到陈邦傅军中躲避，但陈邦傅刚被王彦从狱中放出来，哪里敢收他。

孙金鼎随欲再逃，但却被陈邦傅士卒拦下，只听其对手下人言：“靖江王败亡在即，某正欲与其划清界限，以免王彦抓某把柄不放，今幸得金鼎自来送死，某当趁此擒戮，以邀大功，表明立场也！”

孙金鼎随被陈邦傅所杀，首级擦灰包扎，快马送往梧州。

桂林城内，杨国威知道一旦城破，他做为最初拥立靖江王的魁首之一，必然难逃一死，所以他散尽家财，再次招募了一万人马，准备拼死一搏，但他手下旗鼓焦琏等人却不想陪着靖江王殉葬。

时，随着官军在战场上的胜利，被软禁在桂林城内的瞿式耜，行动越来越自由，不少城中官员，都已经暗中投靠于他，以希望官军入城后，能对他们从轻发落。

瞿式耜随利用这些官员，了解城外局势，并联络杨国威属下焦琏，于夜间大开城门，放丁魁楚部入城，杨国威、顾奕等人纷纷被官军擒获。

九月二十五日，瞿式耜同丁魁楚发兵攻打靖江王府邸，监国不到两月的朱亨嘉被官军生擒。

十月初，朱亨嘉和同谋文武二十余人，被王彦派人押往福京，隆武帝大喜，命锦衣卫王子龙，用心防护，并让刑部侍郎马思理从速审判。

靖江王迅速失败，使得隆武皇帝的地位得到一丝巩固，在闽的亲王、郡王，纷纷写表上奏，承认隆武帝乃大明天子。

隆武二年四月，刑部正是判定《靖案》，杀杨国威、顾奕、史其文等于市。废除靖江王爵位，贬为庶人，命人安置于连江，不许见一人，说一语。

同年又命锦衣卫王子龙，缢杀之，托言暴毙而死。

在平定朱亨嘉叛乱之后，桂林城内，丁魁楚与瞿式耜的矛盾，随慢慢显现出来，但丁魁楚凭借四将兵马，稳压瞿式耜一头，瞿式耜无奈，只得离开桂林，前往南宁，广西势力随一分为二。

王彦从梧州回到广州之后，隆武帝的加封旨意正好到来，他摆下香案接旨，便听内侍宣旨道：“卿有拥戴之功，又有速平逆寇之巨绩，今加封为楚国公，当精忠朝廷，不负恩德。”

王彦随领旨谢恩，又命人带内侍下去歇息，但内侍却言：“还需去桂林宣旨。”，便匆匆离开。

王彦被封为楚国公，手下之人也都得到相应的封赏，但他心中却并不欢喜，反而存在一丝疑惑，平定靖江王之乱，只能算是小功，无论如何，也换不来国公的爵位哩。

“这是陛下急需广东和公爷支持，才如此过誉封赏也！”陈邦彦见王彦忧心，随笑道。

王彦闻言，觉得有理，但他知道还有一层意思，是陈邦彦没有说的，那便是随着他远离福京，与陛下缺乏交流，君臣之间的信任，已经大不如前矣。